replication的在一些特殊应用下可能会导致数据不同步的。譬如：特殊函数。所以出现这个问题的最可能的原因就是超出了mysql复制的一些限制。你可以查官方文档关于replication的限制。

在mysql community， 是有几种不用hold master tables创建slave的方法存在。以下这个比较直接，可以看看http://plusbryan.com/mysql-replication-without-downtime

同意楼上的观点，增量备份还可以使用 percona-xtrabackup。