银行容器是直接运行在物理机的linux上，还是运行在云平台的虚拟机上，这两种方式哪种好？

都可以。如果已经有虚拟化平台了，直接在现有虚拟化的基础上用就行（利用现有的虚拟化优势），如果没有建虚拟化平台，或者容器性能要求特别高，那就跑物理机。
目前看到的大多数都建设好虚拟化平台了，容器跑虚机的比例还是比较大的。