在双活数据中心设计的过程中，采购成本容易控制，而运行维护成本却是隐性的，应该如何控制？

这个没法控制，这就要求负责系统建造方能对系统、业务、周边、未来发展等等很熟悉，并且能做到3~5年的规模、管理等都在考虑在系统设计上。
运维成本主要人力、资源、扩展、维保等等方面。首先你要充足的人力可支配，有人可用，能干事干好事；还有考虑机器、软件等等维保开支；还有系统随着业务的发展，扩展性能不能满足生产要求；有没有充足的资源，保证生产正常运行。
成熟稳定的团队才是运维任何系统不二法宝。

如果说你想降低运维难度，或者说减少运维成本，推荐采用成熟简单的架构，越简单越好，技术出现问题也容易解决，当然这同时也会降低的双活有效性，还需要看你们的RPO/RTO，不过运维成本无法避免的一个问题。