数据仓库建设的一点疑问

因为我从没有实施过数据仓库的建设，所以一直对数据仓库的建设原理不是很了解，但是自己自学一段时间以后感觉有那么点头绪了。
不过我有个疑问：
一家企业，我为他们做数据仓库建设。首先 他们是有自己的生产数据库系统的，以及其他系统。我帮他们在一台新服务器上建立一个数据仓库。就是把企业中的其他数据源的数据全部录入到数据仓库里。我第一次实施etl过程的时候，的确会把他们所有数据库里的数据录入数据库，但是过了一个生产周期，比如一天，一月，或者一个季度，他们生产数据库里的数据又有了新数据，这样的话我又得重新执行etl过程，再把所有数据库的数据录入到数据仓库。其实这是可行的，但是有问题的，因为只需要录入更新后的数据，而不是再次的全库刷新。而我找不到一个很好的办法来实施类似刷新的功能。
因为刷新的标志是不一样的，有些可能是根据时间戳来刷新的，但有些又不是。很麻烦，纠结中。有人能指点下么？