IBM POWER8 HPC系统加速SMT8多线程基因组分析

文章要点

• 使用 x86 处理器体系结构和使用 POWER8 处理器体系结 构制作 De Bruijn 图比较

• 在 IBM POWER8(40 节点)HPC 集群上实现基于 Hadoop 的基因组分析 - 相较于现有集群,计算节点数少 2/3,而运 行时性能提升近 3 倍

• 利用基于 POWER8 的集群,路易斯安那州立大学 (LSU) 得 以在合理时间期限内完成大规模元基因组数据集分析

• 有证据证明,IBM SMT8(可实现高效并行化的同时多线程 技术)是促成洞察速度提高 3 倍的主要因素。

• 数据和计算密集工作负载使用 IBM Spectrum Scale 文件系 统能获得卓越性能

• 探讨 Spectrum Scale 带给基因组分析的更多好处 (例如,ILM、提高容错能力,以及文件系统容量)